Dos son los principales obstáculos con que se topan los muchos buscadores de los escritos de san Juan de la Cruz: la radicalidad de su mensaje y la imposibilidad de lograr una visión clara y armónica del mismo. La primera hay que asumirla sin más, ya que tal radicalidad es la misma del Evangelio. La segunda dificultad no radica en la inteligencia y comprensión de cada argumento tratado ni en el texto concreto que se tiene delante. Lo que exige una preparación adecuada es la comprensión global y la ordenación sistemática de una doctrina que tuvo que impartir el Santo en unas circunstancias muy poco propicias a tal sistematización.